[Offre pourvue] Offre de stage M2

Interactions phages-bactéries dans des modèles de communautés microbiennes inspirées du cidre

Les communautés bactériennes des produits alimentaires fermentés sont connues pour leurs propriétés technologiques et leur potentiel santé. Les bactériophages (phages), virus spécifiques des bactéries, ciblent directement ces dernières ; ils sont ainsi suspectés d’avoir un rôle dans la construction et les fluctuations des écosystèmes microbiens auxquels ils sont associés. Un manque flagrant de données existe néanmoins en ce qui concerne l’impact des communautés de phages (phageome) au sein des écosystèmes alimentaires, et en particulier dans des aliments peu décrits tels que le cidre. Ce stage vise à comprendre les mécanismes d’interaction phages-bactéries gouvernant les équilibres microbiens au sein des aliments fermentés, et influençant, par conséquent, la qualité du produit fini.

L’enjeu de ce travail sera de comprendre comment le phageome d’un aliment fermenté tel que le cidre influence la construction et l’évolution des équilibres entre populations microbiennes. Ceci sera mis en œuvre par le développement de communautés microbiennes modèles pour l’étude spécifique de ces équilibres phages-bactéries.

Le/la stagiaire participera à l’élaboration des communautés modèles et à l’étude des interactions entre microorganismes en mettant en œuvre des techniques de microbiologie classique (suivis de cultures par dénombrements, par mesure de la densité optique, etc.), de méthodes moléculaires (protéomique, PCR, etc.) et biochimiques (dosage des acides organiques et des sucres par HPLC, etc.).

Ce projet apportera de nouvelles connaissances relatives aux communautés microbiennes alimentaires pour leur maîtrise durable à long terme, en prenant en compte le rôle des phages dans les équilibres microbiens, ce qui n’a encore jamais été étudié dans les aliments jusqu’à présent.

Encadrants : Marion Dalmasso et Pierre Ledormand

Contact + Modalités de réponse : Merci d’adresser un CV + lettre de motivation par mail à marion.dalmasso@unicaen.fr et pierre.ledormand@unicaen.fr

Lieu du stage : Campus 1 Caen, Laboratoire Malim, UR ABTE

Soutenance de thèse de Chaimaa Nassamer

La soutenance de la thèse de Chaimaa Nassamer dirigée par Jérôme Ledauphin et intitulée « présence et distribution les CO-HAPs dans les fruits et légumes : mises au point méthodologiques et applications à des jardins potagers urbains » aura lieu le 15 Juin 2020 en comité restreint en raison des contraintes sanitaires.

Dans le Phénix info de janvier « Mois sans tabac » : un défi collectif !

Pour la deuxième année consécutive, l’Université a proposé un accompagnement au sevrage tabagique à 40 étudiants fumeurs de Caen et
de Cherbourg.

Ce projet s’inscrit dans le cadre d’une action de prévention
impulsée et coordonnée par Mathilde Lechevrel (ABTE · EA 4651, UFR Santé) en partenariat avec l’unité de coordination tabacologique du
CHU de Caen Normandie.

Retrouvez l’article dans le Phénix info de janvier 2020 (p15)

    Dynamiser un réseau microfluidique pour mieux le contrôler : des travaux d’ABTE publiés dans

    D. J. Case, Y. Liu, I. Z. Kiss, J.-R. Angilella & A. E. Motter, Braess’s paradox and programmable behaviour in microfluidic networks, Nature 574, 647 (2019).

    La microfluidique consiste à manipuler des écoulements de fluide dans de tout petits canaux, de volume inférieur au millionième de litre. Ces microcanaux se sont avérés très utiles depuis plusieurs décennies pour réaliser de véritables « laboratoires sur puces », dans lesquels circulent des fluides que l’on va utiliser pour transporter des molécules en solution ou des suspensions de petits objets de nature diverse (cellules biologiques, microparticules, etc.). Ils permettent ainsi de réaliser des opérations de transport, de mélange ou de séparation, d’un grand intérêt en génie chimique, en biologie ou en médecine (synthèse de molécules, tri cellulaire, identification d’agents biologiques, lecteur de glycémie, etc.). Cependant, les actions de contrôle de ces écoulements, comme la fermeture et l’ouverture d’une branche ou le changement de sens et de débit, reposent en général sur des parties fixes ou mobiles pilotées par des dispositifs extérieurs à la puce, ce qui constitue un sérieux frein au développement de cette technologie. Malgré d’actives recherches, on est encore loin de la microfluidique reconfigurable et programmable à souhait.

    Lire la suite ici.