Empreintes métaboliques d’échantillons environnementaux et alimentaires par LC-HRMS (WatersTM VION IMS-qTOF)
Catégorie : Offre d’emploi
[Offre pourvue] Offre de stage M2
Interactions phages-bactéries dans des modèles de communautés microbiennes inspirées du cidre
Les communautés bactériennes des produits alimentaires fermentés sont connues pour leurs propriétés technologiques et leur potentiel santé. Les bactériophages (phages), virus spécifiques des bactéries, ciblent directement ces dernières ; ils sont ainsi suspectés d’avoir un rôle dans la construction et les fluctuations des écosystèmes microbiens auxquels ils sont associés. Un manque flagrant de données existe néanmoins en ce qui concerne l’impact des communautés de phages (phageome) au sein des écosystèmes alimentaires, et en particulier dans des aliments peu décrits tels que le cidre. Ce stage vise à comprendre les mécanismes d’interaction phages-bactéries gouvernant les équilibres microbiens au sein des aliments fermentés, et influençant, par conséquent, la qualité du produit fini.
L’enjeu de ce travail sera de comprendre comment le phageome d’un aliment fermenté tel que le cidre influence la construction et l’évolution des équilibres entre populations microbiennes. Ceci sera mis en œuvre par le développement de communautés microbiennes modèles pour l’étude spécifique de ces équilibres phages-bactéries.
Le/la stagiaire participera à l’élaboration des communautés modèles et à l’étude des interactions entre microorganismes en mettant en œuvre des techniques de microbiologie classique (suivis de cultures par dénombrements, par mesure de la densité optique, etc.), de méthodes moléculaires (protéomique, PCR, etc.) et biochimiques (dosage des acides organiques et des sucres par HPLC, etc.).
Ce projet apportera de nouvelles connaissances relatives aux communautés microbiennes alimentaires pour leur maîtrise durable à long terme, en prenant en compte le rôle des phages dans les équilibres microbiens, ce qui n’a encore jamais été étudié dans les aliments jusqu’à présent.
Encadrants : Marion Dalmasso et Pierre Ledormand
Contact + Modalités de réponse : Merci d’adresser un CV + lettre de motivation par mail à marion.dalmasso@unicaen.fr et pierre.ledormand@unicaen.fr
Lieu du stage : Campus 1 Caen, Laboratoire Malim, UR ABTE
Offre de thèse en Chimie Analytique sur les Hydrocarbures Aromatiques Polycycliques
Sujet : Hydrocarbures Aromatiques Polycycliques dans les Végétaux
situés en milieu Urbain : effets saisonnier et climatique
Direction de Thèse : Dr Jérôme Ledauphin (MCF HDR)
En collaboration avec le Dr Nathalie Sauret (MCF, Institut de Chimie
de Nice)
Offre de thèse en radiobiologie
Un sujet de thèse dans l’équipe ToxEMAC est ouvert au concours de l’Ecole doctorale EdNBISE. Pour connaitre le descriptif complet de l’offre et les modalités de candidature, voir ici :
Offre de thèse : Interactions bactériophages-bactéries au sein des communautés microbiennes des aliments fermentés (Offre pourvue)
Un sujet de thèse dans l’équipe MALIM est ouvert au concours de l’Ecole doctorale EdNBISE. Pour connaitre le descriptif complet de l’offre et les modalités de candidature, cliquer ici.
Offre de stage M2 – Offre pourvue
Sujet proposé : Etude des bactériophages de produits cidricoles
Contacts : Envoyer CV et lettre de motivation au format pdf à :
Marion Dalmasso / Marina Crétenet
Offre de stage M2 – Année universitaire 2018-2019
Sujet proposé : Caractérisation du spectre d’activité et du mode d’action d’une souche bactérienne à activité anti-Salmonella en contexte laitier.
Encadrement : Margot Schlusselhuber / Alexandra Besnard
Contact + Modalités de réponse : Merci d’adresser un CV + lettre de motivation par mail à margot.schlusselhuber@unicaen.fr
Offre de stage de M2 (2018-2019) : Evaluation de la toxicité de particules de fumigènes (ToxEMAC).
Sujet proposé : « Evaluation de la toxicité de particules de fumigènes après expositions répétées in vitro de modèles pulmonaires humains ».
Contact : Véronique ANDRE veronique.andre@unicaen.fr
Proposition de stage de M2 pour l’année 2018-2019
Évaluation de l’impact de polluants environnementaux sur un modèle de microbiote intestinal humain
Contacts :
Le stage sera encadré par le Dr Caroline AMIEL et le Pr Jean Michel Panoff
Envoyez CV et lettre de motivation à caroline.amiel@unicaen.fr
Offre de thèse sur la production de polyhydroxyalcanoates (bioplastiques)
Effets de la source de carbone, de l’apport azoté et de l’oxygénation sur la production de polyhydroxyalcanoates (PHA) biosourcés chez Bacillus megaterium
Financement : Conseil Régional de Normandie, 36 mois à partir de septembre 2018, salaire brut annuel : 21 k€.
Contacts :
Directeur de thèse : Pr. Ridha Mosrati ridha.mosrati@unicaen.fr
Co-directeur : Dr. David Corroler david.corroler@unicaen.fr