MALIM

Matrices Alimentaires et Microbiotes

Les travaux de recherche de l’équipe MALIM s’insèrent dans l’axe transversal d’ABTE « Ressources au service de l’aliment, de l’environnement et de la santé ».

Afin d’accompagner la production d’aliments sains et durables, les recherches que nous menons au sein de l’équipe MALIM visent à mieux connaitre le microbiote des aliments et les relations entre sa structure et ses fonctions. Nous explorons les microbiotes d’intérêt alimentaire, pour :

• Générer des connaissances sur les microorganismes (bactéries, levures et moisissures, phages) au sein des écosystèmes alimentaires :
  • En décrivant les microbiotes,
  • En élucidant les mécanismes impliqués dans les interactions entre microorganismes,
  • En analysant la réponse des microbiotes aux contraintes de leur environnement.
• Etudier les services associés aux microorganismes :
  • En caractérisant les génomes et les fonctions des souches et/ou communautés microbiennes
  • En évaluant l’innocuité des souches et/ou communautés
  • En explorant le potentiel de transfert industriel des souches et communautés microbiennes en tant que ferments ou cultures d’intérêt.

L’équipe MALIM s’intéresse plus particulièrement :

• A l’étude des réservoirs microbiens prairiaux et des interactions plantes -microorganismes dans la phyllosphère,
• Aux services écosystémiques associés aux microorganismes en filières fromagères, dans le cadre du projet ANR cAnOPee,
• A la diversité microbienne des laits crus et à l’influence des pratiques de production (projets DEFI et DETEC STEC),
• Au développement de nouveaux ferments pour le renforcement des caractéristiques des fromages, notamment dans le cadre des projets INFINYLEV, ID-TYP, PROSE et AERONEF,
• Aux rôles des écosystèmes microbiens, et en particulier les bactéries lactiques, dans des produits fermentés à base de pommes, notamment dans le cadre du projet MoNARC et du projet NABAB,
• A la production par les micro-organismes de composés à activité antimicrobienne pour le contrôle des flores d’altération et/ou pathogènes au sein des matrices alimentaires, les projets CESam et COVER en sont des exemples,
• A l’influence des communautés de bactériophages sur la structure et le fonctionnement des communautés microbiennes en lien avec l’aliment, notamment dans le cadre du projet PHAGEOME,
• A l’étude de l’impact des éléments métalliques sur la diversité et les interactions microbiennes, comme dans le projet XéMI,
• Au développement de nouveaux modèles d’étude, en mettant par exemple à profit la microfluidique, notamment dans le cadre du projet RIN émergent MI2B.

Les travaux de recherche de l’équipe MALIM s’appuient entre autres sur des ressources microbiennes collectées au cours de plus de 30 années de recherche et rassemblées au sein de la collection UCMA (14000 isolats) dans le Centre de biodiversité des microorganismes.

L’équipe MALIM assure la direction du Groupement d’Intérêt Scientifique (GIS) GALAN. Ce GIS associe l’Université de Caen Normandie et la filière laitière AOP de Normandie (560 producteurs de lait et 24 transformateurs). Il a pour objectifs de mieux connaître et maîtriser les différentes dimensions de la qualité des laits et fromages AOP normands et de conserver et valoriser la biodiversité microbienne d’intérêt laitier (via le CONOBIAL, Conservatoire Normand de la Microbiodiversité Alimentaire qui préserve 5000 isolats régionaux).

MALIM est membre des RMT Florepro et RMT Filières fromagères valorisant leurs terroirs.

L’équipe MALIM est localisée dans le bâtiment M sur le campus 1.

Adresse : ABTE, Université de Caen Normandie, Esplanade de la paix CS 14032, 14032 CAEN cedex 5

Tél : 02 31 56 56 21