{"id":673,"date":"2018-05-17T17:07:20","date_gmt":"2018-05-17T15:07:20","guid":{"rendered":"http:\/\/abte.eu\/?page_id=673"},"modified":"2018-05-17T17:07:20","modified_gmt":"2018-05-17T15:07:20","slug":"offre-de-these-sur-la-production-de-polyhydroxyalcanoates","status":"publish","type":"page","link":"https:\/\/abte.eu\/index.php\/ecotea\/offre-de-these-sur-la-production-de-polyhydroxyalcanoates\/","title":{"rendered":"Offre de th\u00e8se sur la production de polyhydroxyalcanoates"},"content":{"rendered":"<h3><strong>Effets de la source de carbone, de l\u2019apport azot\u00e9 et de l\u2019oxyg\u00e9nation sur la production <\/strong><strong>de polyhydroxyalcanoates (PHA) biosourc\u00e9s chez <em>Bacillus megaterium<\/em><\/strong><\/h3>\n<p><em>Financement\u00a0:<\/em> \u00a0\u00a0 Conseil R\u00e9gional de Normandie, 36 mois \u00e0 partir de septembre 2018, salaire brut annuel\u00a0: 21 k\u20ac.<\/p>\n<p><strong><em>Contexte\u00a0:<\/em><\/strong><\/p>\n<p>Parmi les bioplastiques de substitution aux plastiques d\u2019origine p\u00e9trochimique, les polyesters de type polyhydroxyalcanoates (PHA) produits par voie microbienne sont fr\u00e9quemment mis en avant. Ces biopolym\u00e8res stock\u00e9s sous forme de granules intracellulaires constituent une r\u00e9serve carbon\u00e9e pour les microorganismes. Leur synth\u00e8se survient en r\u00e9ponse \u00e0 des d\u00e9s\u00e9quilibres nutritionnels, classiquement une limitation en azote, mais aussi en phosphore ou d\u2019autres \u00e9l\u00e9ments, coupl\u00e9e \u00e0 un exc\u00e8s en substrat carbon\u00e9. Leur structure d\u00e9pend de nombreux facteurs, notamment de la souche et de la source de carbone. Ces polyesters sont class\u00e9s en deux cat\u00e9gories selon la longueur de leurs chaines lat\u00e9rales\u00a0: les homo- ou copolym\u00e8res \u00e0 chaine courte, scl-PHA, et les h\u00e9t\u00e9ro-polym\u00e8res \u00e0 chaine moyenne, mcl-PHA. La composition monom\u00e9rique du polyester et son poids mol\u00e9culaire conditionnent ses propri\u00e9t\u00e9s physiques et thermom\u00e9caniques, et donc ses applications.<\/p>\n<p>La plupart des bact\u00e9ries sauvages accumule une seule cat\u00e9gorie de PHA, scl ou mcl. Cependant, des travaux r\u00e9cents men\u00e9s au laboratoire ont r\u00e9v\u00e9l\u00e9 l\u2019existence d\u2019un m\u00e9tabolisme atypique chez une bact\u00e9rie \u00e0 Gram positif\u00a0: <em>Bacillus megaterium<\/em>. Ce micro-organisme produit ainsi les deux types de PHA, l\u2019un ou l\u2019autre selon les conditions de culture qui lui sont impos\u00e9es (Shahid <em>et al<\/em>, J Biosci Bioeng, 2013, 116:302).<\/p>\n<p><strong><em>Objectifs\u00a0:<\/em><\/strong><\/p>\n<p>L\u2019\u00e9tude consistera \u00e0 caract\u00e9riser chez <em>Bacillus megaterium<\/em> les conditions de culture permettant d\u2019orienter son m\u00e9tabolisme vers un type de PHA pr\u00e9d\u00e9termin\u00e9, scl- ou mcl-, et de favoriser son accumulation. L\u2019am\u00e9lioration de la productivit\u00e9 en PHA devra concilier l\u2019obtention de hautes densit\u00e9s bact\u00e9riennes et des teneurs \u00e9lev\u00e9es en biopolym\u00e8re. Ces aspects seront \u00e9tudi\u00e9s selon la m\u00e9thodologie du \u00ab\u00a0Plan d\u2019Exp\u00e9riences\u00a0\u00bb, portant d\u2019abord sur des milieux synth\u00e9tiques comprenant plusieurs substrats carbon\u00e9s et combinant diff\u00e9rents ratios C\/N\/O<sub>2<\/sub>. Les bior\u00e9acteurs instrument\u00e9s automatis\u00e9s et les \u00e9quipements analytiques du laboratoire (analyseur de gaz en ligne, spectroscopie FTIR, GC-MS, HPLC, etc.) permettent la mise en place de proc\u00e9d\u00e9s de fermentation innovants et une analyse fiable des diff\u00e9rents compos\u00e9s cibl\u00e9s dans cette \u00e9tude. Les donn\u00e9es obtenues seront confront\u00e9es aux voies m\u00e9taboliques actives, en lien avec les aspects bio\u00e9nerg\u00e9tiques (bilans carbone, oxyg\u00e8ne, ATP, cofacteurs r\u00e9duits\u2026) afin d\u2019appr\u00e9cier la dynamique de r\u00e9partition du flux de carbone (en biomasse cellulaire, PHA et m\u00e9tabolites) et l\u2019effet de la concentration en nutriments sur les cin\u00e9tiques de croissance et de production de PHA. Un int\u00e9r\u00eat particulier sera port\u00e9 \u00e0 l\u2019\u00e9tude des conditions d\u00e9clenchant la commutation anabolique des scl-PHA vers les mcl-PHA et sur sa r\u00e9versibilit\u00e9. Les r\u00e9sultats obtenus sur les milieux synth\u00e9tiques devront permettre de d\u00e9finir des modes de culture efficients pour la production de PHA. Les solutions retenues seront test\u00e9es sur des sous-produits d\u2019agro-industrie en vue de leur valorisation en PHA.<\/p>\n<p><strong><em>M\u00e9thodologies :<\/em><\/strong><\/p>\n<p>Microbiologie, m\u00e9tabolisme, fermentation en bior\u00e9acteur instrument\u00e9, spectroscopie IRTF, GC-MS, HPLC, plan d\u2019exp\u00e9riences, traitement statistique des donn\u00e9es.<\/p>\n<p><strong>Profil des candidats :<\/strong><\/p>\n<p>Le(a) candidat(e) doit \u00eatre titulaire d\u2019un Master-2 ou d\u2019un dipl\u00f4me \u00e9quivalent (ing\u00e9nieur\u2026). Il ou elle doit poss\u00e9der de solides connaissances en microbiologie, fermentation et techniques analytiques associ\u00e9es. Une forte motivation pour la recherche et une bonne capacit\u00e9 \u00e0 communiquer en anglais seront appr\u00e9ci\u00e9es. Les \u00e9tudiants int\u00e9ress\u00e9s doivent contacter les r\u00e9f\u00e9rents indiqu\u00e9s et leur soumettre leurs dossiers de candidature qui doivent comprendre\u00a0: une lettre de motivation, un CV d\u00e9taill\u00e9, les r\u00e9sultats obtenus en M1 et M2 ou \u00e9quivalent, et les coordonn\u00e9es compl\u00e8tes de leurs encadrants de stage de M1 et M2. Les candidats s\u00e9lectionn\u00e9s seront inform\u00e9s par courriel mi-mai et convoqu\u00e9s pour une audition la derni\u00e8re semaine de mai 2018.<\/p>\n<p><strong>Contacts :<\/strong><\/p>\n<p>Directeur de th\u00e8se\u00a0: Pr. Ridha Mosrati\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0 <a href=\"mailto:ridha.mosrati@unicaen.fr\">ridha.mosrati@unicaen.fr<\/a><\/p>\n<p>Co-directeur\u00a0: Dr. David Corroler\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0 <a href=\"mailto:david.corroler@unicaen.fr\">david.corroler@unicaen.fr<\/a><\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>Effets de la source de carbone, de l\u2019apport azot\u00e9 et de l\u2019oxyg\u00e9nation sur la production de polyhydroxyalcanoates (PHA) biosourc\u00e9s chez Bacillus megaterium Financement\u00a0: \u00a0\u00a0 Conseil R\u00e9gional de Normandie, 36 mois \u00e0 partir de septembre 2018, salaire brut annuel\u00a0: 21 k\u20ac. 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