Cette approche vise \u00e0 \u00e9tablir un profil de la diversit\u00e9 fongique et bact\u00e9rienne, obtenue par s\u00e9quen\u00e7age des ADN, au sein d\u2019environnements int\u00e9rieurs et ext\u00e9rieurs. Les s\u00e9quences d\u2019int\u00e9r\u00eat seront confirm\u00e9es par PCR quantitative. Ces travaux permettront de progresser dans l\u2019\u00e9tude de l\u2019exposition humaine aux bioa\u00e9rosols en milieux professionnels (secteurs agricoles, hospitaliers,\u2026) ainsi que dans les habitats d\u00e9grad\u00e9s. Une meilleure caract\u00e9risation et compr\u00e9hension de la diversit\u00e9 et de la dynamique des esp\u00e8ces microbiennes pr\u00e9sentes ainsi que les param\u00e8tres environnementaux qui influencent la virulence (production de mycotoxines par exemple) contribuera \u00e0 une meilleure connaissance de l\u2019impact des contaminants a\u00e9riens dans le d\u00e9veloppement de maladies respiratoires. <\/p>\n\n\n\n
- Etude du r\u00f4le des bact\u00e9riophages sur la dynamique du microbiote au sein de matrices alimentaires (\u00e9quipe MALIM)<\/strong><\/li><\/ul>\n\n\n\n
Les bact\u00e9ries associ\u00e9es aux produits alimentaires ferment\u00e9s (fromages, boissons ferment\u00e9es, etc.) sont bien connues pour leur potentiel technologique et sant\u00e9. De nombreux travaux se sont pench\u00e9s sur la diversit\u00e9 de ces communaut\u00e9s bact\u00e9riennes et sur les flux microbiens au sein de ces \u00e9cosyst\u00e8mes complexes. Il existe actuellement un manque flagrant de donn\u00e9es scientifiques concernant l\u2019impact des communaut\u00e9s de bacteriophages, ou phageomes, sur la dynamique de ces communaut\u00e9s bact\u00e9riennes alimentaires. Dans d\u2019autres \u00e9cosyst\u00e8mes bact\u00e9riens complexes, tels que le tube digestif humain, le phageome est pressenti comme jouant un r\u00f4le de \u00ab biomarqueur \u00bb de sant\u00e9 ou de maladie. Mais son r\u00f4le et sa diversit\u00e9 restent encore \u00e0 \u00eatre \u00e9tablis quel que soit l\u2019\u00e9cosyst\u00e8me consid\u00e9r\u00e9. Cette partie du projet vise donc \u00e0 mieux comprendre la composition et la diversit\u00e9 du phageome en lien avec la composition bact\u00e9rienne d\u2019aliments ferment\u00e9s de Normandie. Ceci sera possible par la mise en \u0153uvre de s\u00e9quen\u00e7age \u00e0 haut d\u00e9bit de phageomes et de microbiotes issus de diff\u00e9rentes matrices alimentaires. Ce travail permettra de poser les bases pour am\u00e9liorer l\u2019\u00e9tude des fluctuations de la composition en bact\u00e9riophages des matrices alimentaires en lien avec la composition bact\u00e9rienne, afin de mieux appr\u00e9hender les relations existant entre les communaut\u00e9s bact\u00e9riennes et phagiques. Ces r\u00e9sultats ouvriront la porte \u00e0 une meilleure compr\u00e9hension de la construction des \u00e9cosyst\u00e8mes alimentaires et de leur \u00e9volution. <\/p>\n\n\n\n
Ce projet est men\u00e9 en collaboration avec les laboratoires LMSM (porteur du programme) et PBS-BRICS de l’Universit\u00e9 de Rouen et du CNRS, dans le cadre de l’axe \u00ab\u00a0S\u00e9curit\u00e9 Sanitaire et Aliments Durables\u00a0\u00bb de la COMUE Normandie-Universit\u00e9.<\/p>\n\n\n\n
Ce projet est cofinanc\u00e9 par l\u2019Union Europ\u00e9enne et la R\u00e9gion Normandie dans le cadre du programme op\u00e9rationnel FEDER\/ FSE 2014-2020. <\/p>\n\n\n\n
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Le programme RNAmb (R\u00e9seau Normand d\u2019Analyse microbiotes et biofilms) financ\u00e9 dans le cadre de l\u2019AMI r\u00e9gional RIN (R\u00e9seaux d\u2019Int\u00e9r\u00eat Normand) a pour objectif g\u00e9n\u00e9ral l’\u00e9tude des microbiotes par l’utilisation d’outils globaux comme la m\u00e9tag\u00e9nomique. Au sein de l’UR ABTE, deux aspects seront particuli\u00e8rement d\u00e9velopp\u00e9s : Etude du microbiote bact\u00e9rien et fongique a\u00e9rien (\u00e9quipe ToxEMAC) : … Continuer la lecture de « Programme RIN RNAmb »<\/span><\/a><\/p>\n","protected":false},"author":1,"featured_media":0,"parent":0,"menu_order":1,"comment_status":"closed","ping_status":"closed","template":"","meta":{"footnotes":""},"class_list":["post-1246","page","type-page","status-publish","hentry"],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/abte.eu\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/pages\/1246","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/abte.eu\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/pages"}],"about":[{"href":"https:\/\/abte.eu\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/types\/page"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/abte.eu\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/users\/1"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/abte.eu\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=1246"}],"version-history":[{"count":3,"href":"https:\/\/abte.eu\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/pages\/1246\/revisions"}],"predecessor-version":[{"id":1250,"href":"https:\/\/abte.eu\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/pages\/1246\/revisions\/1250"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/abte.eu\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=1246"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}
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